タンパク質分子のフォールディングの統計力学
安部晴男・輪湖 博 著


ここでは、協同研究者である安部晴男さんが中心となって書かれた本(PDF版)を
ご紹介しています
 
「・・・ タンパク質のフォールディング・メカニ ズムの解明は,険阻な絶壁をもつ難攻不落の高山であろうと思われる.一方,この高山への登頂過程の道筋には,いたるところに美しい花が咲き乱 れる花園が開けているかもしれない. タンパク質フォールディングの統計力学的解明は,この本の最後の頁から,真の問題が展開すると思っている.この分野を解明しょうとする人々にとって,我々の提案が,何らか の手引きに少しでもなるなら,著者らにとって,それは望外の幸せであろう. ・・・ 」(本文 はじめに より)


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   表紙_はじめに_目次
   第1章_タンパク質分子の研究は何故重要なのか?
   第2章_タンパク質分子のフォールディング問題とは?
   第3章_タンパク質分子はボルツマン分布など聞いたこともない!
   第4章_タンパク質のフォールディング過程の統計力学モデルの導入
   第5章_統計力学モデルとシミュレーションによる熱力学量を比較しよう!
   第6章_アミノ酸置換によって熱力学量はどのように変化するか?
   第7章_フォールディングのキネティクスにおけるレートと緩和時間との関係は?
   第8章_タンパク質フォールディングの遷移状態の構造を推定するΦ値解析とは?
   第9章_統計力学モデルを用いたΦ値計算とフォールディング・メカニズム
   第10章_理論と実験によるΦ値の相関の検証_その1
   第11章_理論と実験によるΦ値の相関の検証_その2
   第12章_“あとがき”にかえて:『フォールディング・メカニズムの統一的スキーム』
   著者紹介_索引

    附章1 発展トピック
  附章2 漸化式より分配関数を求めるFORTRANプログラムと解説



関連論文(1)

Characterization of protein folding by a Φ-value calculation with a statistical-mechanical model.
Abe, H. and Wako, H.
Biophysics and Physicobiology (2016) 13, 263-279.  [doi: 10.2142/biophysico.13.0_263"]

Calculation of Free-Energy Profiles, Folding Rates, and Φ-Values by Means of a Simple Statistical-Mechanical Model of Protein Folding.
Wako, H. and Abe, H.
In Advances in Protein Folding Research, Mathew Hale Ed., Nova Science Publishers, Inc., N.Y. (2016) 19-63. 

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Folding/unfolding kinetics of lattice proteins by applying a simple statistical mechanical model for protein folding.
Wako, H. and Abe, H.
In Protein Folding, E.C. Walters Ed., Nova Science Publishers, Inc., N.Y. (2011) 349-376. 
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Folding/unfolding kinetics of lattice proteins studied using a simple statistical mechanical model for protein folding, I: Dependence on native structures and amino acid sequences.
Abe, H. and Wako, H.
Physica A (2009) 388, 3442-3454.  [doi: 10.1016/j.physa.2009.05.020]

Single Amino Acid Substitutions in Lattice Proteins Using Statistical Mechanical Model for Protein Folding.
Wako, H. and Abe, H.
J. Phys. Soc. Jpn (2007) 76, 104801.  [doi: 10.1143/JPSJ.76.104801]

Analyses of simulations of three-dimensional lattice proteins in comparison with a simplified statistical mechanical model of protein folding.
Abe, H. and Wako, H.
Phys. Rev. E (2006) 74, 011913.  [doi: 10.1103/PhysRevE.74.011913]

Application of a statistical mechanical model for protein folding to a three-dimensional lattice protein.
Abe, H. and Wako, H.
J. Phys. Soc. Jpn (2004) 73,  1143-1146    [doi: 10.1143/JPSJ.73.1143]


関連論文(2)

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Biopolymers (1981)  20,  991-1011  [doi: 10.1002/bip.1981.360200511]

Noninteracting local-structure model of folding and unfolding transition in globular proteins. II. Application to two-dimensional lattice proteins conformation I. General considerations and the application to homopolymers.
H. Abe and N. Go.
Biopolymers (1981)  20,  1013-31  [doi: 10.1002/bip.1981.360200512]

Statistical mechanical theory of the protein conformation I. General considerations and the application to homopolymers.
Wako, H. and Saito, N.
J. Phys. Soc. Jpn (1978)  44,  1931-1938  [doi: 10.1143/JPSJ.44.1931]

Statistical mechanical theory of the protein conformation II. Folding pathway for protein.
Wako, H. and Saito, N.
J. Phys. Soc. Jpn (1978)  44,  1939-1945  [doi: 10.1143/JPSJ.44.1939]