基準振動解析 Gallery

4UV3 ー 細菌アミロイド分泌タンパク質CsgG

 

【PDBデータ】PDB ID: 4UV3.　細菌アミロイド分泌タンパク質CsgG

【基準振動解析】基準振動　Mode No. 1を（左）カートゥーン・モデル表示　

（右）空間充填モデル表示の断面図

【メモ】

（下記主引用文献の Fig. 2 より引用）（左）カートゥーン表示　（右）断面図。
OM (outer membrane) とあるのは、外膜に埋もれる部分を指し、36本のβストランドからなるβバレルで構成される。αヘリックスからなる下部構造はペリプラズムに露出した部分で、右の図では、 溶液が入り込める大きな空洞（半径35Å、高さ40Å）がみてとれる（グラム陰性細菌は，細胞膜（内膜）の外側に外膜をもつ。ペリプラズムは，内膜と外膜に挟 まれた領域を指す。ペリプラズムには，栄養分を細胞（質）内に取り込むための分解酵素や結合タンパク質が存在する。）

主引用文献：　Goyal, P., et al., Structural and Mechanistic Insights Into the Bacterial Amyloid Secretion Channel CsgG. Nature, 516:250-, 2014