基準振動解析 Gallery

1RYS ー チミンダイマーをもつDNAと
DNAポリメラーゼの複合体


   

【PDBデータ】PDB ID: 1RYS. cis-syn チミンダイマーをもつDNAと
DNAポリメラーゼの複合体。
【基準振動解析】DNAを除いて、DNAポリメラーゼだけで基準振動解析計算を行った。
DNAは、アニメーション制作の段階で付け加えた。(上段左)Mode No. 1、
(上段右)Mode No. 1、ただしDNAは非表示。上段の2つの図はまったく同じ計算結果で、
DNAを付加して表示しているか、していないかの違いだけである。(下段左)Mode No. 2、
(下段右)Mode No. 3.  振動周期はモードにより異なるが、便宜上、同じ周期で表現している。

【図の説明】タンパク質をカートゥーン表示で、DNAを空間充填モデルで表示した。

主引用文献: Ling, H., Boudsocq, F., Plosky, B., Woodgate, R., Yang, W., Replication of a Cis-Syn Thymine Dimer at Atomic Resolution.  Nature, 424:1083-1087, 2003.